Nejznámější je Billy Corgan jako zpěvák a kytarista alternativní rockové skupiny Smashing Pumpkins, která existovala od roku 1988 do roku 2000. V roce 2006 se kapela znovu spojila. V roce 2007 vyšlo nové album od Smashing Pumpkins s názvem Zeitgeist. Kromě Corgana se na tomto albu podílel pouze bubeník Jimmy Chamberlin z původních členů kapely. Se Smashing Pumpkins vydal šest alb, z nichž byla Siamee Dream, Mellon Collie a Infinite Sadness nejúspěšnější.