Mills se narodila v Aldershotu v Hampshire. Když byla Mills ve věku 9 let, její matka opustila své tři děti (Heather, její staršího bratra Shana a mladší sestru Fiona) a nechala je v péči svého manžela.

V roce 2007 se Mills zúčastnila čtvrtého ročníku pořadu Dancing with the Stars. V tomto pořadu získala 7. místo z 11 možných. Zúčastnila se také 5. ročníku britského programu Dancing on Ice.

8. srpna 1993 byla Mills sražena na ulici v Londýně policejním motocyklem. V důsledku nehody v říjnu lékaři museli amputovat levou nohu od kolena dolů. Mills dostala od policie 200 000 liber jako kompenzace za její zranění a trvalé následky. Policista, který způsobil nehodu, přišel o řidičský průkaz.

Mills se setkala McCartney v Dorchesteru během Pride of Britain Awards v dubnu 1999. 11. června 2002, čtyři roky po smrti jeho první manželky, Lindy McCartney, měl pár svatbu. Mají dceru Beatrice Milly McCartneyovou, narozenou 28. října 2003. V roce 2008 semanželé rozvedli.